Cвятейший Патриарх Московский и всея Руси (1990 - 2008 гг) Алексий во время своего Патриаршего визита по Тверской земле называл обитель жемчужиной Тверской епархии. Даже невзирая на все разрушения, постигшие от безбожной власти, эта обитель при всем этом предстоит пред нами во всей своей красе и величии гения зодчества, благочестивых предков земли Русской. Впереди предстоят колоссальные работы, чтобы возвратить бывшее благолепие сего благословенного и укрепленного молитвами преп. Нила Столобенского уголка. Таких намоленных уголков теперь осталось немного, и они должны стать заповедными, а чтобы это свершилось, необходимо возродить великое свойство русского православного народа - его любовь ко Христу, включающую в себя любовь к Святым Божиим Церквам. Ведь мы знаем, что в своем огромном большинстве русские православные люди жили в избах, крытых соломой, - а храмы они созидали как дворцы. Ограничивали себя в бытовых условиях, но зато покрывали храмы вызолоченными куполами, а иконостасы, как и прочие предметы церковного обихода, сооружали из самого драгоценного материала.

Так наш русский народ, движимый любовью ко Христу, не жалел никаких средств в своих пожертвованиях на Церковь. Поэтому таковых можно сравнить с той евангельской женой, которая разбила алавастровый сосуд с драгоценным миром и излила на голову Христу, на удивление неверующих и не любящих Христа людей.

Небольшой остров Столобный, освященный молитвой, трудами и духовными подвигами преподобного Нила, стал местом его вечного упокоения. Со временем он не был забыт благочестивыми христианами, но притягивал к себе ищущих спасения. Некоторые проживали на острове вблизи мощей преподобного Нила месяцами и даже годами. Это была «странствующая Бога ради братия», которых в прежние времена из мирян и монахов было немало. Преподобный же, стяжавший у Бога дар дерзновенной молитвы, и по смерти предстательствовал за всех приходящих к нему с верой и чтущих его благословенную память.
Одним из таких паломников был иеромонах Герман. Родившись недалеко от Столобного острова и вступив в братство самого близкого к острову Николо-Рожковского монастыря, он много слышал о жизни и подвигах преподобного. Отец Герман глубоко почитал столобенского подвижника и, питая к нему великое благоговение и любовь, желал написать повествование о его жизни. Он часто посещал остров, как для духовного утешения, так и для того, чтобы услышанное о святом отшельнике поверять и дополнять новыми свидетельствами.

Много трагических событий совершилось на маленьком клочке святой земли - острове Столобный - за 70 лет безбожной власти. В годы лихолетий не одна святая обитель подверглась разорению и надругательству. Земля Русская, как жемчугом усеянная множеством храмов и монастырей, была опустошена и осквернена.
То, что создавалось веками, было уничтожено за считанные годы. Вера православная всегда была на Руси оплотом духовности и святости. Вера и святость были не в бездушном камне, но в душах человеческих. Несмотря на тяжкие испытания, народ православный явил беспримерный подвиг веры и преданности воле Божией, и Господь не оставил народа своего, помянул кровь мученическую, пролитую за Создателя и Спасителя мира.
В 1988 году Русская Православная Церковь торжественно отмечала великую дату - тысячелетие Крещения Руси. С этого момента начинается долгожданное и скорое возрождение духовной жизни в России. Православной Церкви возвращаются храмы и монастыри. Воистину это милость Божия. Из «гнилых сосудов» Господь творит себе пастырей, монахов и благочестивых мирян. И, как сказано в Евангелии, в последние времена «Он собирает жатву в житницу свою».
Господь проявил к нам такую милость по неотступным ходатайствам Пречистой Его Матери, Богородицы Приснодевы Марии, и по молитвам бесчисленного сонма святых небожителей и новомучеников.

За прошедшие 18 лет в обители с Божьей помощью уже немало сделано. Увеличилось количество братии, открылось подворье в городе Торжке, основался скит на месте св. Оковецкого источника в Селижаровском районе. Братия монастыря принимает активное участие в общественной жизни Тверской епархии. Ведутся архивные изыскания исторического наследия монастыря, по крупицам собираются уникальные документы и рукописи. Так, например, в Москве, в Российской Государственной библиотеке, была найдена уникальная рукопись «Жития преп. Нила», датируемая 1630 годом, писанная основателем обители и первым ее настоятелем, преп. Германом (Тулуповым).